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Tiangen DP117無(wú)內(nèi)毒素質(zhì)粒大提試劑盒用戶指南:高純度質(zhì)粒制備技術(shù)方案

更新時(shí)間:2025-05-02      點(diǎn)擊次數(shù):792

Tiangen DP117無(wú)內(nèi)毒素質(zhì)粒大提試劑盒用戶指南:高純度質(zhì)粒制備技術(shù)方案

一、產(chǎn)品核心特性與工作原理

1. 技術(shù)優(yōu)勢(shì)與試劑盒組成

  • 核心特性

    • 高效去內(nèi)毒素:采用硅膠膜吸附技術(shù)結(jié)合去內(nèi)毒素系統(tǒng),內(nèi)毒素去除率>99%,殘留量<0.1 EU/μg DNA,符合細(xì)胞轉(zhuǎn)染及動(dòng)物實(shí)驗(yàn)標(biāo)準(zhǔn);

    • 超螺旋結(jié)構(gòu)保留:通過(guò)溫和裂解體系(P2緩沖液)與多步離心過(guò)濾(CS1過(guò)濾器),超螺旋質(zhì)粒占比>85%,顯著提升轉(zhuǎn)染效率;

    • 高通量處理:?jiǎn)未慰商幚?00-200 mL菌液,高拷貝質(zhì)粒得率達(dá)500-1500 μg,低拷貝質(zhì)粒得率200-600 μg,滿足大規(guī)模實(shí)驗(yàn)需求。

  • 試劑盒組成

    • 裂解系統(tǒng):溶液P1(含RNase A)、溶液P2(裂解液)、溶液P4(中和液);

    • 純化系統(tǒng):平衡液BL、漂洗液PW(含無(wú)水乙醇)、無(wú)水乙醇、洗脫液TB;

    • 耗材:吸附柱CP6(50 mL離心管適配)、收集管、過(guò)濾器CS1。

2. 適用范圍與兼容性

  • 下游應(yīng)用

    • 常規(guī)實(shí)驗(yàn):酶切、PCR、測(cè)序、連接、轉(zhuǎn)化;

    • 實(shí)驗(yàn):基因治療載體構(gòu)建、顯微注射、RNA干擾、CRISPR-Cas9基因編輯;

    • 細(xì)胞實(shí)驗(yàn):適用于內(nèi)毒素敏感型細(xì)胞(如Huh7、HEK293T)的轉(zhuǎn)染,轉(zhuǎn)染效率較普通質(zhì)粒提升30%-50%。

  • 質(zhì)粒兼容性

    • 拷貝數(shù):高拷貝質(zhì)粒(如pUC19)推薦菌液量100 mL,低拷貝質(zhì)粒(如pBR322)推薦菌液量200 mL;

    • 大小范圍:支持1-20 kb質(zhì)粒提取,對(duì)于>10 kb大質(zhì)粒,需增加菌液量及裂解液體積。

二、典型應(yīng)用場(chǎng)景與實(shí)驗(yàn)方案

1. 基因治療載體構(gòu)建

  • 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)

    1. 使用DP117提取慢病毒載體骨架質(zhì)粒(如pLVX-IRES-ZsGreen1),菌液量200 mL;

    2. 定量檢測(cè)濃度(OD260)及純度(OD260/OD280=1.8-2.0),瓊脂糖凝膠電泳驗(yàn)證超螺旋結(jié)構(gòu);

    3. 結(jié)合Lipofectamine 3000轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞,48小時(shí)后熒光顯微鏡觀察轉(zhuǎn)染效率>80%。

  • 結(jié)果示例

    • 提取的質(zhì)粒濃度達(dá)1.2 μg/μL,內(nèi)毒素含量0.05 EU/μg,顯著低于普通試劑盒(>1 EU/μg);

    • 慢病毒滴度達(dá)1×10? TU/mL,較含內(nèi)毒素質(zhì)粒提升40%。

2. CRISPR-Cas9基因編輯

  • 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)

    1. 提取sgRNA表達(dá)質(zhì)粒(如pX458),菌液量100 mL;

    2. 通過(guò)DP117去除內(nèi)毒素,避免非特異性免疫激活;

    3. 核轉(zhuǎn)染HeLa細(xì)胞,72小時(shí)后T7E1酶切驗(yàn)證編輯效率>35%。

  • 結(jié)果示例

    • 提取的質(zhì)粒OD260/OD280=1.85,內(nèi)毒素未檢出;

    • 基因編輯效率較含內(nèi)毒素質(zhì)粒提升25%,脫靶率降低15%。

3. 動(dòng)物體內(nèi)實(shí)驗(yàn)

  • 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)

    1. 提取治療性基因表達(dá)質(zhì)粒(如pAAV-CMV-GFP),菌液量200 mL;

    2. 通過(guò)DP117確保內(nèi)毒素<0.1 EU/μg,避免小鼠注射后發(fā)熱反應(yīng);

    3. 尾靜脈注射C57BL/6小鼠(50 μg/只),7天后肝臟組織GFP熒光強(qiáng)度較含內(nèi)毒素質(zhì)粒組提升60%。

  • 結(jié)果示例

    • 質(zhì)粒純度(OD260/OD280=1.92)及內(nèi)毒素水平符合FDA要求;

    • 動(dòng)物存活率100%,無(wú)炎癥反應(yīng)。

三、操作規(guī)范與注意事項(xiàng)

1. 實(shí)驗(yàn)前準(zhǔn)備

  • 試劑配制

    1. 溶液P1:加入RNase A后混勻,4℃保存;

    2. 漂洗液PW:按標(biāo)簽要求加入無(wú)水乙醇;

    3. 洗脫液TB:65-70℃預(yù)熱以提高洗脫效率。

  • 儀器校準(zhǔn)

    • 離心機(jī):確保轉(zhuǎn)速誤差<2%(8000 rpm對(duì)應(yīng)8228×g);

    • 移液器:定期校準(zhǔn),避免體積誤差。

2. 操作流程

  • 菌體收集

    1. 100-200 mL菌液8000 rpm離心3分鐘,棄上清;

    2. 菌體沉淀用吸水紙吸干殘留培養(yǎng)基。

  • 裂解與中和

    1. 加入8 mL溶液P1,渦旋振蕩至菌體懸浮;

    2. 加入8 mL溶液P2,溫和翻轉(zhuǎn)6-8次,室溫放置5分鐘;

    3. 加入8 mL溶液P4,立即翻轉(zhuǎn)6-8次,室溫放置10分鐘。

  • 過(guò)濾與純化

    1. 裂解液8000 rpm離心5分鐘,上清倒入過(guò)濾器CS1,緩慢推動(dòng)推柄過(guò)濾;

    2. 濾液加入0.3倍體積異丙醇,分兩次過(guò)吸附柱CP6;

    3. 依次加入10 mL漂洗液PW、3 mL無(wú)水乙醇洗滌,8000 rpm離心2分鐘棄廢液;

    4. 空柱8000 rpm離心5分鐘,去除乙醇?xì)埩簟?/p>

  • 洗脫與保存

    1. 吸附柱置于新收集管,加入1-2 mL預(yù)熱洗脫液TB,室溫放置5分鐘;

    2. 8000 rpm離心2分鐘,收集質(zhì)粒溶液,-20℃保存。

3. 實(shí)驗(yàn)后處理

  • 廢棄物處理

    • 含內(nèi)毒素的菌體沉淀及濾液按生物危害品處理;

    • 染菌的耗材121℃高壓滅菌30分鐘。

  • 儀器維護(hù)

    • 吸附柱CP6為一次性耗材,禁止重復(fù)使用;

    • 離心機(jī)轉(zhuǎn)子用70%乙醇擦拭,避免腐蝕。

四、常見(jiàn)問(wèn)題解答

Q1:提取的質(zhì)粒濃度低如何解決?
A:

  1. 檢查菌液OD600值,推薦高拷貝質(zhì)粒1.8-2.0,低拷貝質(zhì)粒2.0-2.5;

  2. 確保菌體懸浮,避免裂解不充分;

  3. 延長(zhǎng)洗脫時(shí)間至10分鐘,或重復(fù)洗脫一次。

Q2:內(nèi)毒素殘留超標(biāo)怎么辦?
A:

  1. 確認(rèn)溶液P4與CS1過(guò)濾器未過(guò)期;

  2. 裂解液離心時(shí)間延長(zhǎng)至15分鐘,確保內(nèi)毒素充分沉淀;

  3. 使用LAL法驗(yàn)證內(nèi)毒素水平,必要時(shí)增加乙醇洗滌次數(shù)。

Q3:如何提高大質(zhì)粒(>10 kb)的得率?
A:

  1. 菌液量增加至300 mL,裂解液P1/P2/P4按比例增加至12 mL;

  2. 洗脫液TB預(yù)熱至70℃,洗脫體積增加至3 mL;

  3. 吸附后靜置10分鐘再離心,增強(qiáng)結(jié)合效率。




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